Huy Tuấn sinh năm 1970 tại Hạ Long, Quảng Ninh trong một gia đình không mấy khá giả có bố làm trong lĩnh vực thể thao và mẹ làm nghề buôn bán tự do. Dù không phải là “con nhà nòi” nhưng ngay từ những năm tháng trung học, anh đã sớm bộc lộ năng khiếu âm nhạc và niềm đam mê với nghệ thuật. Khi Nhà nước có chính sách tìm kiếm tài năng trẻ tại các địa phương để đào tạo ngành nghề, Huy Tuấn ngay lập tức nộp đơn đăng ký và sau đó được chọn vào khoa Flute tại Nhạc viện Hà Nội. Kết thúc 4 năm sơ cấp, vì học giỏi mà anh được các chuyên gia Liên Xô sang trường tuyển thẳng vào Nhạc viện Tchaikovsky, ngôi trường âm nhạc cổ điển hàng đầu châu Âu, để tiếp tục theo học nâng cao bộ môn sáo tây. Đây chính là một cơ hội lớn, là bước đệm giúp anh phát triển tài năng và theo đuổi sự nghiệp âm nhạc của mình sau này.

Năm 1990, Liên Xô tan rã. Theo bạn bè, từ Nga, Huy Tuấn đi sang Ba Lan, rồi sang Đức, kiếm sống bằng nhiều nghề để có tiền học sáng tác nhạc.